Edinburgh Research Explorer

Prof Andrew Rambaut, FRSE

Personal Chair in Molecular Evolution

  1. 2017
  2. Adaptive MCMC in Bayesian phylogenetics: an application to analyzing partitioned data in BEAST

    Baele, G., Lemey, P., Rambaut, A. & Suchard, M. A. 15 Jun 2017 In : Bioinformatics.

    Research output: Contribution to journalArticle

  3. Establishment and cryptic transmission of Zika virus in Brazil and the Americas

    Rambaut, A. & 71 others Faria, N. R., Quick, J., Morales, I., Theze, J., Jesus, J. G., Giovanetti, M., Kraemer, M. U. G., Hill, S. C., Black, A., da Costa, A. C., Silva, S. P., Raghwani, J., Cauchemez, S., du Plessis, L., Verotti, M. P., de Oliveira, W. K., Carmo, E. H., Coelho, G. E., Santelli, A. C. F. S., Vinhal, L. C., Henriques, C. M., Simpson, J. T., Loose, M., Anderson, K. G., Grubaugh, N. D., Somasekar, S., Chiu, C. Y., Munoz-Medina, J. E., Gonzalez-Bonilla, C. R., Arias, C. F., Lewis-Ximenez, L. L., Baylis, S. A., Chieppe, A. O., Aguiar, S. F., Fernandes, C. A., Lemos, P. S., Nascimento, B. L. S., Monteiro, H. A. O., Siqueira, I. C., de Queiroz, M. G., de Souza, T. R., Bezerra, J. F., Lemos, M. R., Pereira, G. F., Loudal, D., Moura, L. C., Dhalia, R., Franca, R. F., Magalhaes, T., Marques, E. T. J., Jaenisch, T., Wallau, G. L., de Lima, M. C., Nascimento, V., de Cerqueira, E. M., de Lima, M. M., Mascarenhas, D. L., Moura Neto, J. P., Levin, A. S., Tozetto-Mendoza, T. R., Fonseca, S. N., Mendes-Correa, M. C., Milagres, F. P., Segurado, A., Holmes, E. C., Bedford, T., Nunes, M. R. T., Sabino, E. C., Alcantara, L. C. J., Loman, N. & Pybus, O. G. 15 Jun 2017 In : Nature.

    Research output: Contribution to journalArticle

  4. Genome sequencing reveals Zika virus diversity and spread in the Americas

    Rambaut, A. & 59 others Metsky, H. C., Matranga, C. B., Wohl, S., Schaffner, S. F., Freije, C. A., Winnicki, S., West, K., Qu, J., Baniecki, M. L., Gladden-Young, A., Lin, A. E., Christopher, T-T., Ye, S. H., Park, D. J., Luo, C., Barnes, K. G., Shah, R. R., Chak, B., Barbosa-Lima, G., Delatorre, E., Vieira, Y. R., Paul, L. M., Tan, A. L., Barcellona, C. M., Porcelli, M. C., Vasquez, C., Cannons, A. C., Cone, M. R., Hogan, K. N., Kopp IV, E. W., Anzinger, J. J., Garcia, K. F., Parhap, L. A., Gelvez Ramirez, R. M., Montoya, M., Rojas, D. P., Brown, C. M., Hennigan, S., Sabina, B., Scotland, S., Gangavarapu, K., Grubaugh, N. D., Oliveira, G., Robles-Sikisaka, R., Gehrke, L., Smole, S., Halloran, M. E., Villar Centeno, L. A., Mattar, S., Lorenzana, I., Cerbino-Neto, J., Valim, C., Degrave, W., Bozza, P. T., Souza, T. M. L., Bosch, I., Yozwiak, N. L., MacInnis, B. L. & Sabeti, P. C. 24 May 2017 In : Nature.

    Research output: Contribution to journalArticle

  5. Genomic epidemiology reveals multiple introductions of Zika virus into the United States

    Rambaut, A. & 68 others Grubaugh, N. D., Ladner, J. T., Kraemer, M. U. G., Dudas, G., Tan, A. L., Gangavarapu, K., Wiley, M. R., White, S., Theze, J., Magnani, D. M., Prieto, K., Reyes, D., Bingham, A., Paul, L. M., Robles-Sikisaka, R., Oliveira, G., Pronty, D., Barcellona, C. M., Metsky, H. C., Baniecki, M. L., Barnes, K. G., Chak, B., Freije, C. A., Gladden-Young, A., Gnirke, A., Luo, C., MacInnis, B., Matranga, C. B., Park, D. J., Qu, J., Schaffner, S. F., Christopher, T-T., West, K. L., Winnicki, S. M., Wohl, S., Yozwiak, N. L., Quick, J., Fauver, J. R., Khan, K., Brent, S. E., Reiner Jr, R. C., Lichtenberger, P. N., Ricciardi, M., Bailey, V. K., Watkins, D. I., Cone, M. R., Kopp IV, E. W., Hogan, K. N., Cannons, A. C., Jean, R., Monaghan, A. J., Garry, R. F., Loman, N. J., Faria, N. R., Porcelli, M. C., Vasquez, C., Nagle, E. R., Cummings, D. A. T., Stanek, D., Sanchez-Lockhart, M., Sabeti, P. C., Gillis, L. D., Michael, S. F., Bedford, T., Pybus, O. G., Isern, S., Palacios, G. F. & Andersen, K. G. 24 May 2017 In : Nature.

    Research output: Contribution to journalArticle

  6. Virus genomes reveal factors that spread and sustained the Ebola epidemic

    Rambaut, A. & 73 others Dudas, G., Carvalho, L. M., Bedford, T., Tatem, A. J., Baele, G., Faria, N. R., Park, D. J., Ladner, J. T., Arias, A., Asogun, D., Bielejec, F., Caddy, S., Cotten, M., D'ambrozio, J., Dellicour, S., Di Caro, A., Diclaro II, J. W., Duraffour, S., Elmore, M. J., Fakoli III, L. S., Faye, O., Gilbert, M. L., Gevao, S. M., Gire, S. K., Gladden-Young, A., Gnirke, A., Goba, A., Grant, D. S., Haagmans, B. L., Hiscox, J. A., Jah, U., Kargbo, B., Kugelman, J. R., Liu, D., Malboeuf, C. M., Mate, S., Matthews, D. A., Matranga, C. B., Meredith, L. W., Qu, J., Quick, J., Pas, S. D., Phan, M. V. T., Pollakis, G., Reusken, C. B., Sanchez-Lockhart, M., Schaffner, S. F., Schieffelin, J. S., Sealfon, R. S., Simon-Loriere, E., Smits, S. L., Stoecker, K., Thorne, L., Tobin, E. A., Vandi, M. A., Watson, S. J., West, K., Whitmer, S. L. M., Wiley, M. R., Winnicki, S. M., Wohl, S., Wölfel, R., Yozwiak, N. L., Andersen, K. G., Blyden, S. O., Bolay, F. K., Carroll, M. W., Dahn, B., Diallo, B., Formenty, P., Fraser, C., Suchard, M. A. & Lemey, P. 12 Apr 2017 In : Nature.

    Research output: Contribution to journalArticle

  7. Bayesian nonparametric clustering in phylogenetics: modeling antigenic evolution in influenza

    Cybis, G. B., Sinsheimer, J. S., Bedford, T., Rambaut, A., Lemey, P. & Suchard, M. A. 18 Jan 2017 In : STATISTICS IN MEDICINE.

    Research output: Contribution to journalArticle

  8. Emerging concepts of data integration in pathogen phylodynamics

    Baele, G., Suchard, M. A., Rambaut, A. & Lemey, P. 1 Jan 2017 In : Systematic biology.

    Research output: Contribution to journalArticle

  9. 2016
  10. Genome sequences of a novel vietnamese bat bunyavirus

    Chase-Topping, M. , Ivens, A. L. , Lu, L. , Rambaut, A. , Simmonds, P. , Woolhouse, M. & 115 others Oude Munnink, B. B., Phan, M. V. T., Hoek, L. V. D., Kellam, P., Cotten, M., Kiet, B. T., Baker, S., Berto, A., Boni, M. F., Bryant, J. E., Phu, B. D., Campbell, J. I., Carrique-Mas, J., Hung, D. M., Huong, D. T., Oanh, D. T., Day, J. N., Van Tan, D., van Doorn, H. R., Han, D. A., Farrar, J. J., Trang, H. T. T., Nghia, H. D. T., Long, H. B., Van Duong, H., Thu, H. T. K., Cuong, L. C., Hung, L. M., Phuong, L. T., Phuc, L. T., Phuong, L. T., Luat, L. X., Thu Ha, L. T., Van Chuong, L., Loan, M. T. P., Nadjm, B., Bao, N. T., Hoa, N. T., Tue, N. T., Tu, N. C., Thuan, N. D., Dong, N., Chuyen, N. K., An, N. N., Vinh, N. N., Hung, N. Q., Dung, N. T., Minh, N. T., Binh, N. T., Tham, N. T. H., Tien, N. T. H., Chuc, N. T. K., Ngoc, N. T. L., Ha, N. T. L., Lien, N. T. N., Diep, N. T. N., Nhung, N. T., Chau, N. T. S., Chi, N. T. Y., Trinh, N. T., Van, N. T., Van Cuong, N., Van Hung, N., Van Kinh, N., Hoang, N. V. M., Van My, N., Van Thang, N., Van Thanh, N., Van Vinh Chau, N., Van Xang, N., My, P. H., Anh, P. H., Khoa, P. T. M., Tam, P. T. T., Van Lao, P., Van Minh, P., Van Be Bay, P., My, P. V. T., Rabaa, M. A., Rahman, M., Thompson, C., Thwaites, G., Ngan, T. T. D., Nhu, T. D. H., Chau, T. H. M., Toan, T. K., Phuc, T. M., Hong, T. T. K., Dung, T. T. N., Thanh, T. T. T., Minh, T. T. T., Nguyen, T. T., Hien, T. T., Tri, T. Q., Hien, V. B., Tai, V. N., Cuong, V. Q., Phat, V. V., Huong, V. U. T. L., Hang, V. T. T., Wertheim, H., Bogaardt, C., Nyugen, D., Deijs, M., Jebbink, M. F., Jazaeri Farsani, S. M., Dodd, K., Euren, J., Lucas, A., Ortiz, N., Pennacchio, L., Rubin, E., Saylors, K. E., Hai, T. M. & Wolfe, N. D. 22 Dec 2016 In : Genome announcements. 4, 6, e0136616

    Research output: Contribution to journalArticle

  11. Unusual Ebola Virus Chain of Transmission, Conakry, Guinea, 2014-2015

    Keita, M., Duraffour, S., Loman, N. J., Rambaut, A., Diallo, B., Magassouba, N., Carroll, M. W., Quick, J., Sall, A. A., Glynn, J. R., Formenty, P., Subissi, L. & Faye, O. Dec 2016 In : Emerging Infectious Diseases. 22, 12, p. 2149-2152 4 p.

    Research output: Contribution to journalArticle

  12. Ebola Virus Glycoprotein with Increased Infectivity Dominated the 2013-2016 Epidemic

    Diehl, W. E., Lin, A. E., Grubaugh, N. D., Carvalho, L. M., Kim, K., Kyawe, P. P., McCauley, S. M., Donnard, E., Kucukural, A., McDonel, P., Schaffner, S. F., Garber, M., Rambaut, A., Andersen, K. G., Sabeti, P. C. & Luban, J. 3 Nov 2016 In : Cell. 167, 4, p. 1088-+ 17 p.

    Research output: Contribution to journalArticle

Previous 1 2 3 4 5 6 7 8 ...20 Next