Rob Young

DR

Accepting PhD Students

Personal profile

Education/Academic qualification

Bioinformatics, Doctor of Philosophy (PhD), University of Oxford

1 Oct 200728 Sept 2011

Award Date: 28 Sept 2011

Quantitative Genetics and Genome Analysis, Master of Science, University of Edinburgh

1 Sept 200531 Aug 2006

Award Date: 28 Nov 2006

Natural Sciences, Bachelor of Arts, University of Cambridge

1 Sept 200230 Jun 2005

Award Date: 30 Jun 2005

Fingerprint

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Collaborations and top research areas from the last five years

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  • The contribution of evolutionarily volatile promoters to molecular phenotypes and human trait variation

    Young, R. S., Talmane, L., Marion de Proce, S. & Taylor, M. S., 4 Apr 2022, In: Genome Biology. 23, 89.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

    Open Access
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  • Discovery of widespread transcription initiation at microsatellites predictable by sequence-based deep neural network

    Grapotte, M., Saraswat, M., Bessière, C., Menichelli, C., Ramilowski, J. A., Severin, J., Hayashizaki, Y., Itoh, M., Tagami, M., Murata, M., Kojima-ishiyama, M., Noma, S., Noguchi, S., Kasukawa, T., Hasegawa, A., Suzuki, H., Nishiyori-sueki, H., Frith, M., Abugessaisa, I., Aitken, S., & 471 othersAken, B. L., Alam, I., Alam, T., Alasiri, R., Alhendi, A. M. N., Alinejad-rokny, H., Alvarez, M. J., Andersson, R., Arakawa, T., Araki, M., Arbel, T., Archer, J., Archibald, A. L., Arner, E., Arner, P., Asai, K., Ashoor, H., Astrom, G., Babina, M., Baillie, J. K., Bajic, V. B., Bajpai, A., Baker, S., Baldarelli, R. M., Balic, A., Bansal, M., Batagov, A. O., Batzoglou, S., Beckhouse, A. G., Beltrami, A. P., Beltrami, C. A., Bertin, N., Bhattacharya, S., Bickel, P. J., Blake, J. A., Blanchette, M., Bodega, B., Bonetti, A., Bono, H., Bornholdt, J., Bttcher, M., Bougouffa, S., Boyd, M., Breda, J., Brombacher, F., Brown, J. B., Bult, C. J., Burroughs, A. M., Burt, D. W., Busch, A., Caglio, G., Califano, A., Cameron, C. J., Cannistraci, C. V., Carbone, A., Carlisle, A. J., Carninci, P., Carter, K. W., Cesselli, D., Chang, J., Chen, J. C., Chen, Y., Chierici, M., Christodoulou, J., Ciani, Y., Clark, E. L., Coskun, M., Dalby, M., Dalla, E., Daub, C. O., Davis, C. A., De Hoon, M. J. L., De Rie, D., Denisenko, E., Deplancke, B., Detmar, M., Deviatiiarov, R., Di Bernardo, D., Diehl, A. D., Dieterich, L. C., Dimont, E., Djebali, S., Dohi, T., Dostie, J., Drablos, F., Edge, A. S. B., Edinger, M., Ehrlund, A., Ekwall, K., Elofsson, A., Endoh, M., Enomoto, H., Enomoto, S., Faghihi, M., Fagiolini, M., Farach-carson, M. C., Faulkner, G. J., Favorov, A., Fernandes, A. M., Ferrai, C., Forrest, A. R. R., Forrester, L. M., Forsberg, M., Fort, A., Francescatto, M., Freeman, T. C., Frith, M., Fukuda, S., Funayama, M., Furlanello, C., Furuno, M., Furusawa, C., Gao, H., Gazova, I., Gebhard, C., Geier, F., Geijtenbeek, T. B. H., Ghosh, S., Ghosheh, Y., Gingeras, T. R., Gojobori, T., Goldberg, T., Goldowitz, D., Gough, J., Greco, D., Gruber, A. J., Guhl, S., Guigo, R., Guler, R., Gusev, O., Gustincich, S., Ha, T. J., Haberle, V., Hale, P., Hallstrom, B. M., Hamada, M., Handoko, L., Hara, M., Harbers, M., Harrow, J., Harshbarger, J., Hase, T., Hasegawa, A., Hashimoto, K., Hatano, T., Hattori, N., Hayashi, R., Hayashizaki, Y., Herlyn, M., Hettne, K., Heutink, P., Hide, W., Hitchens, K. J., Sui, S. H., ’t Hoen, P. A. C., Hon, C. C., Hori, F., Horie, M., Horimoto, K., Horton, P., Hou, R., Huang, E., Huang, Y., Hugues, R., Hume, D., Ienasescu, H., Iida, K., Ikawa, T., Ikemura, T., Ikeo, K., Inoue, N., Ishizu, Y., Ito, Y., Itoh, M., Ivshina, A. V., Jankovic, B. R., Jenjaroenpun, P., Johnson, R., Jorgensen, M., Jorjani, H., Joshi, A., Jurman, G., Kaczkowski, B., Kai, C., Kaida, K., Kajiyama, K., Kaliyaperumal, R., Kaminuma, E., Kanaya, T., Kaneda, H., Kapranov, P., Kasianov, A. S., Kasukawa, T., Katayama, T., Kato, S., Kawaguchi, S., Kawai, J., Kawaji, H., Kawamoto, H., Kawamura, Y. I., Kawasaki, S., Kawashima, T., Kempfle, J. S., Kenna, T. J., Kere, J., Khachigian, L., Kiryu, H., Kishima, M., Kitajima, H., Kitamura, T., Kitano, H., Klaric, E., Klepper, K., Klinken, S. P., Kloppmann, E., Knox, A. J., Kodama, Y., Kogo, Y., Kojima, M., Kojima, S., Komatsu, N., Komiyama, H., Kono, T., Koseki, H., Koyasu, S., Kratz, A., Kukalev, A., Kulakovskiy, I., Kundaje, A., Kunikata, H., Kuo, R., Kuo, T., Kuraku, S., Kuznetsov, V. A., Kwon, T. J., Larouche, M., Lassmann, T., Law, A., Le-cao, K., Lecellier, C., Lee, W., Lenhard, B., Lennartsson, A., Li, K., Li, R., Lilje, B., Lipovich, L., Lizio, M., Lopez, G., Magi, S., Mak, G. K., Makeev, V., Manabe, R., Mandai, M., Mar, J., Maruyama, K., Maruyama, T., Mason, E., Mathelier, A., Matsuda, H., Medvedeva, Y. A., Meehan, T. F., Mejhert, N., Meynert, A., Mikami, N., Minoda, A., Miura, H., Miyagi, Y., Miyawaki, A., Mizuno, Y., Morikawa, H., Morimoto, M., Morioka, M., Morishita, S., Moro, K., Motakis, E., Motohashi, H., Mukarram, A. K., Mummery, C. L., Mungall, C. J., Murakawa, Y., Muramatsu, M., Murata, M., Nagasaka, K., Nagase, T., Nakachi, Y., Nakahara, F., Nakai, K., Nakamura, K., Nakamura, Y., Nakamura, Y., Nakazawa, T., Nason, G. P., Nepal, C., Nguyen, Q. H., Nielsen, L. K., Nishida, K., Nishiguchi, K. M., Nishiyori, H., Nitta, K., Noguchi, S., Noma, S., Notredame, C., Ogishima, S., Ohkura, N., Ohno, H., Ohshima, M., Ohtsu, T., Okada, Y., Okada-hatakeyama, M., Okazaki, Y., Oksvold, P., Orlando, V., Ow, G. S., Ozturk, M., Pachkov, M., Paparountas, T., Parihar, S. P., Park, S., Pascarella, G., Passier, R., Persson, H., Philippens, I. H., Piazza, S., Plessy, C., Pombo, A., Ponten, F., Poulain, S., Poulsen, T. M., Pradhan, S., Prezioso, C., Pridans, C., Qin, X., Quackenbush, J., Rackham, O., Ramilowski, J., Ravasi, T., Rehli, M., Rennie, S., Rito, T., Rizzu, P., Robert, C., Roos, M., Rost, B., Roudnicky, F., Roy, R., Rye, M. B., Sachenkova, O., Saetrom, P., Sai, H., Saiki, S., Saito, M., Saito, A., Sakaguchi, S., Sakai, M., Sakaue, S., Sakaue-sawano, A., Sandelin, A., Sano, H., Sasamoto, Y., Sato, H., Saxena, A., Saya, H., Schafferhans, A., Schmeier, S., Schmidl, C., Schmocker, D., Schneider, C., Schueler, M., Schultes, E. A., Schulze-tanzil, G., Semple, C. A., Seno, S., Seo, W., Sese, J., Severin, J., Sheng, G., Shi, J., Shimoni, Y., Shin, J. W., Simonsanchez, J., Sivertsson, A., Sjostedt, E., Soderhall, C., Laurent, G. S., Stoiber, M. H., Sugiyama, D., Summers, K. M., Suzuki, A. M., Suzuki, H., Suzuki, K., Suzuki, M., Suzuki, N., Suzuki, T., Swanson, D. J., Swoboda, R. K., Tagami, M., Taguchi, A., Takahashi, H., Takahashi, M., Takamochi, K., Takeda, S., Takenaka, Y., Tam, K. T., Tanaka, H., Tanaka, R., Tanaka, Y., Tang, D., Taniuchi, I., Tanzer, A., Tarui, H., Taylor, M. S., Terada, A., Terao, Y., Testa, A. C., Thomas, M., Thongjuea, S., Tomii, K., Triglia, E. T., Toyoda, H., Tsang, H. G., Tsujikawa, M., Uhlén, M., Valen, E., Van De Wetering, M., Van Nimwegen, E., Velmeshev, D., Verardo, R., Vitezic, M., Vitting-seerup, K., Von Feilitzen, K., Voolstra, C. R., Vorontsov, I. E., Wahlestedt, C., Wasserman, W. W., Watanabe, K., Watanabe, S., Wells, C. A., Winteringham, L. N., Wolvetang, E., Yabukami, H., Yagi, K., Yamada, T., Yamaguchi, Y., Yamamoto, M., Yamamoto, Y., Yamamoto, Y., Yamanaka, Y., Yano, K., Yasuzawa, K., Yatsuka, Y., Yo, M., Yokokura, S., Yoneda, M., Yoshida, E., Yoshida, Y., Yoshihara, M., Young, R., Young, R. S., Yu, N. Y., Yumoto, N., Zabierowski, S. E., Zhang, P. G., Zucchelli, S., Zwahlen, M., Chatelain, C., Carninci, P., De Hoon, M. J. L., Wasserman, W. W., Bréhélin, L. & Lecellier, C., 2 Jun 2021, In: Nature Communications. 12, 1

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

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  • Comparative transcriptomics of primary cells in vertebrates

    Alam, T., Agrawal, S., Severin, J., Young, R., Andersson, R., Amer, E., Hasegawa, A., Lizio, M., Ramilowski, J., Abugessaisa, I., Ishizu, Y., Noma, S., Tarui, H., Taylor, M. S., Lassmann, T., Itoh, M., Kasukawa, T., Kawaji, H., Marchionni, L., Sheng, G., & 5 othersForrest, A. R. R., Khachigian, L. M., Hayashizaki, Y., Carninci, P. & De Hoon, M., 30 Jul 2020, In: Genome Research.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

    Open Access
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  • Functional annotation of human long noncoding RNAs via molecular phenotyping

    Ramilowski, J. A., Yip, C. W., Agrawal, S., Chang, J-C., Ciani, Y., Kulakovskiy, I. V., Mendez, M., Ooi, J. L. C., Ouyang, J. F., Parkinson, N., Petri, A., Roos, L., Severin, J., Yasuzawa, K., Abugessaisa, I., Akalin, A., Antonov, I. V., Arner, E., Bonetti, A., Bono, H., & 96 othersBorsari, B., Brombacher, F., Cameron, C. J. F., Cannistraci, C. V., Cardenas, R., Cardon, M., Chang, H., Dostie, J., Ducoli, L., Favorov, A., Fort, A., Garrido, D., Gil, N., Gimenez, J., Guler, R., Handoko, L., Harshbarger, J., Hasegawa, A., Hasegawa, Y., Hashimoto, K., Hayatsu, N., Heutink, P., Hirose, T., Imada, E. L., Itoh, M., Kaczkowski, B., Kanhere, A., Kawabata, E., Kawaji, H., Kawashima, T., Kelly, S. T., Kojima, M., Kondo, N., Koseki, H., Kouno, T., Kratz, A., Kurowska-Stolarska, M., Kwon, A. T. J., Leek, J., Lennartsson, A., Lizio, M., López-Redondo, F., Luginbühl, J., Maeda, S., Makeev, V. J., Marchionni, L., Medvedeva, Y. A., Minoda, A., Müller, F., Muñoz-Aguirre, M., Murata, M., Nishiyori, H., Nitta, K. R., Noguchi, S., Noro, Y., Nurtdinov, R., Okazaki, Y., Orlando, V., Paquette, D., Parr, C. J. C., Rackham, O. J. L., Rizzu, P., Sánchez Martinez, D. F., Sandelin, A., Sanjana, P., Semple, C. A. M., Shibayama, Y., Sivaraman, D. M., Suzuki, T., Szumowski, S. C., Tagami, M., Taylor, M. S., Terao, C., Thodberg, M., Thongjuea, S., Tripathi, V., Ulitsky, I., Verardo, R., Vorontsov, I. E., Yamamoto, C., Young, R. S., Baillie, J. K., Forrest, A. R. R., Guigó, R., Hoffman, M. M., Hon, C. C., Kasukawa, T., Kauppinen, S., Kere, J., Lenhard, B., Schneider, C., Suzuki, H., Yagi, K., de Hoon, M. J. L., Shin, J. W. & Carninci, P., 27 Jul 2020, (E-pub ahead of print) In: Genome Research. 30, p. 1060-1072

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

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  • Identification of a localized Nonsense-Mediated Decay pathway at the Endoplasmic Reticulum

    Longman, D., Jackson-Jones, K., Maslon, M., Murphy, L., Young, R., Stoddart, J., Hug, N., Taylor, M., Papadopoulos, D. K. & Caceres, J. F., 2 Jul 2020, (E-pub ahead of print) In: Genes & Development. 34, 15-16, p. 1075-1088

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

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